病理研究中心有主要三大任务：(1) 建立组织库；（2）建立现代化的病理技术和疑难病例诊断技术平台；（3）开展人类重大疾病，特别是出生缺陷相关疾病的病理学研究。

　　组织样本库（包括血液、实体组织、尿液，以及石蜡标本和整套资料等）将由全自动化设施管理与操作，提供给基因表达水平、蛋白质水平、形态学以及各种免疫组化的研究使用。

　　现代化病理技术平台则包括：传统病理技术平台、超微病理平台、酶和免疫组织化学技术平台、染色体和核型分析平台、杂交组织化学与细胞的基因原位表达平台、激光组织微切割平台、组织图象分析和三维重构平台、以及人类疾病的动物模型等的制备。

　　在此基础上通过引入超微、免疫和分子遗传学检测等先进手段，结合临床资料及随访结果对疑难病例进行综合的病理诊断，力图达到形成中国人自己的各类遗传病或肿瘤的诊断标准化方案。